Retikulum Endoplasma merupakan membrane berbentuk labirin yang berhubungan dengan selubung inti sel. Retikulum endoplasma dapat berbentuk kantong pipih (sisterna), pipa (tubulus), gelembung (vesikula), atau lembaran. Selain itu, ada dua jenis RE, yaitu RE kasar dan RE halus Pada permukaan membran luar RE kasar terdapat sejumlah ribosom. Adanya ribosom memberikan penampakan kasar (bergranula) pada RE sehingga disebut RE kasar. Retikulum endoplasma kasar berperan dalam sintesis protein karena adanya aktivitas ribosom. Hasil dari sintesis protein tersebut disimpan dan disalurkan ke dalam sitoplasma melalui RE.sesuai dengan namanya, RE halus (agranuler) tidak memiliki ribosom pada permukaan membran luarnya sehingga tampak halus. Retikulum endoplasma halus berperan dalam sintesis dan transportasi glikogen, lemak (kolesterol), dan steroid. Pada sel otot, RE disebut retikulum sarkoplasma dan berfungsi sebagai medium untuk konduksi impuls dan transport ion kalsium (Ca2+) yang diperlukan dalam kontraksi otot.
Ribosom merupakan organel terkecil (berdiameter 20 nm) yang terdapat di dalam sitoplasma sehingga ribosom hanya terlihat dengan bantuan mikroskop elektron.ribosom berbentuk butiran kecil.fungsi ribosom yaitu tempat terjadinya sintetis protein internal. Di dalam sel, ribosom tersuspensi di dalam sitosol atau terikat pada retikulum endoplasma kasar, atau pada membran inti sel. Ribosom adalah komponen sel yang membuat protein dari semua asam amino. Salah satu prinsip utama biologi, sering disebut sebagai "dogma sentral," adalah DNA yang digunakan untuk membuat RNA, yang, pada gilirannya, digunakan untuk membuat protein. Urutan DNA gen disalin ke RNA mRNA. Ribosom kemudian membaca informasi dalam RNA dan menggunakannya untuk membuat protein. Proses ini dikenal sebagai translasi; yaitu, ribosom "menerjemahkan" informasi genetik dari RNA menjadi protein. Ribosom melakukan hal ini dengan mengikat sebuah mRNA dan menggunakannya sebagai template untuk urutan yang benar asam amino pada protein tertentu. Asam amino yang melekat pada RNA transfer tRNA molekul, yang masuk salah satu bagian dari ribosom dan mengikat ke urutan messenger RNA. Asam amino terlampir yang kemudian bergabung bersama oleh bagian lain dari ribosom. Ribosom bergerak sepanjang mRNA, "membaca" urutan dan menghasilkan rantai asam amino. Ribosom terbuat dari kompleks dari RNA dan protein. Ribosom dibagi menjadi dua subunit, satu lebih besar daripada yang lain. Mengikat subunit kecil untuk mRNA, sedangkan mengikat subunit yang lebih besar kepada tRNA dan asam amino. Ketika selesai membaca mRNA ribosom, kedua subunit terpecah. Ribosom telah diklasifikasikan sebagai ribozim, karena RNA ribosomal tampaknya paling penting bagi aktivitas transferase peptidil yang menghubungkan asam amino bersama. Ribosom dari bakteri, archaea dan eukariota tiga domain kehidupan di Bumi, memiliki struktur secara signifikan berbeda dan urutan RNA. Perbedaan-perbedaan dalam struktur memungkinkan beberapa antibiotik untuk membunuh bakteri oleh ribosom menghambat mereka, sementara meninggalkan ribosom manusia tidak terpengaruh. Ribosom dalam mitokondria sel eukariotik mirip pada bakteri, yang mencerminkan asal usul evolusi kemungkinan organel ini berasal dari kata ribosom asam ribonukleat. Ribosom tidak memiliki membran (selaput). Hal ini disebabkan antaralain: 1. Ribosom merupakan organel terkecil. 2. Untuk membuat membran (selaput) harus terdiri dari lipid (lemak) dan protein, sedangkan pada ribosom hanya terdapat protein.
Badan golgi adalah organel yang berfungsi menghasilkan butiran getah,lisosom primer,menyimpan protein dan enzim.Badan golgi ditemukan pertama kali oleh Cammilio Golgi pada tahun 1898 didalam sel-sel kelenjar.struktur Badan golgi berbentuk seperti tumpukan kantong-kantong pipih.dindingnya memiliki 2 permukaan yaitu permukaan luar berbentuk cembung dan permukaan dalam berbentuk cekung.membrannya membentuk kantong yang berlapis-lapis.kantong ini digunakan untuk menyimpan protein dan enzim yang akan disekresikan.sel hewan memiliki 10 samppai 20 badan golgi.membrannya memiliki ketebalan sekitar 6 sampai 8 nm.fungsi badan golgi yaitu membentuk dinding sel pada tumbuhan,menerima produk yang dihasilkan retikulum endoplasma,pusat penerimaan dan pengiriman.
Lisosom merupakan organel kecil berdiameter 0,1 mikrometer dan vesikel berbentuk seerti kantong.Lisosom berisi enzim hidrolitik yang merusak benda asing dan bersifat asam.didalam lisosom terdaat banyak enzim diantaranya enzim nukleasse,protease,lipase,dan amilase.Lisosom dapat melakukan pemrograman kematian sel.
Peroksisom merupakan organel yang menyuruai kantong berbentuk agak bulat,mengandung butiran Kristal,dan diselubungi membrane tunggal. Peroksisom mengandung enzim oksidase dan enzim katalase.fungsi Lisosom untuk menetralisir racun senyawa berbahaya,memecahkan asam lemak menjadi molekul kecil sebagai bahan bakar untuk respirasi sel.
Glioksisom adalah sejenis peroksisom yang ditemukan pada jaringan penyimpan lemak dari biji tumbuhan.Glioksisom berfungsi untuk menghasilkan enzim yang dapat mengubah asam lemak menjadi gula yang akan digunakan sebagai sumber energy pada saat biji sedang berkecambah.
Mitokondria merupakan organel berbentuk silinder dengan panjang 1 sampai 10 mikrometer dan diselubungi oleh dua mebran.membran dalam mitokondria berlekuk-lekuk disebut krista.fungsi mitokondria yaitu penghasil energi
Plastida adalah organel enyiman materi yang diselubungi oleh membran ganda. Plastid dibedakan menjadi 3 yaitu leukoplas,kromoplas,dan kloroplas.fungsi kloroplas adalah fotosintesis.
Vakuola adalah organel yang berbentuk vesikula besar yang berisi cairan.vakuola terbentuk oleh pelipatan membran sel ke dalam.fungsi vakuola yaitu tempat menyimpan pigmen daun,buah,dan bunga,menyerap air,dan menyimpan gas,senyawa-senyawa organik, dan ion anorganik.
Sentrosom merupakan organel tempat tumbuhnya mikrotubula yang terletak didekat nukleus.fungsi sentrosom yaitu mengatur silia primer yang hadir pada sel-sel epitel ginjal.
Sitoskeleton merupakan kerangka sel yang kuat dan lentur.berdasarkan ukurannya sitoskeleton dibedakan menjadi mikrotubula,filament intermediet dan mikrofilamen.