Kepausan tertarik untuk mempertahankan hegemoninya dengan mengukuhkan atau mengabaikan para penguasa dan beberapa dari mereka ingin mempertahankan kekuasaan semata-mata untuk diri mereka sendiri tanpa harus bertanggung jawab kepada pihak ketiga. Tentu saja ada berbagai macam alasan dalam tarik-menarik ini tanpa mengesampingkan faktor ekonomi (dari kedua belah pihak).
Tampaknya pengalaman Paris-lah yang membawa Marsilio mempunyai minat dominan pada persoalan sosial, politik, agama, dan hukum. Ia adalah penasihat pribadi Louis dari Bavaria dalam hal ini dan meskipun usaha yang dilakukan oleh Louis dari Bavaria gagal untuk merebut kekuasaan di Roma, Marsilio terus menjalin hubungan dekat dengan Bavaria setelah ia kembali ke Jerman. Pada tahun-tahun inilah Marsilio mengembangkan gagasannya tentang Negara yang terpisah dari Gereja. Dalam pengertian ini, ia mengembangkan kritik keras terhadap konsepsi teokratis tentang masyarakat, dan condong ke arah teori sosiologi dan politik yang sangat sekuler.
Hal di atas membuat dia dan orang-orang di sekitarnya  Juan de Jandun dan Luis de Bavaria sendiri  mendapatkan segala macam tuduhan dari Paus yang menyebut Marsilio dan Juan de Jandn sebagai bidah, bahkan bid'ah. Akhirnya Marsilio dikucilkan.
Namun gagasan Marsilio -- yang dikembangkan pada paruh pertama abad ke-14 Â memiliki kedalaman yang lebih dari sekadar mempromosikan sekularisme politik. Sekularisme ini, bagaimanapun, tidak berarti penolakan terhadap gagasan tentang Tuhan. Marsilio tetap menerima gagasan semua kekuasaan mempunyai kuasa ilahi sebagai rujukannya. Ia tidak mendukung keyakinan umum kekuasaan raja dan kaisar berasal langsung dari Tuhan. Apa yang disebut sebagai hak ketuhanan raja adalah sesuatu yang asing dalam pemikiran Marsilio. Dan inilah ide revolusioner pada masanya.
Marsilio yakin, jika ada kekuasaan yang berasal dari Tuhan, maka kekuasaan itu milik rakyat, milik rakyat, milik individu-individu yang membentuk konglomerat sosial. Berangkat dari kekuasaan yang dimiliki rakyat, Marsilio mengembangkan teori kedaulatan rakyat yang bertentangan dengan teori Saint Thomas  dipandang sebagai teori yang benar, ortodoks, dan tak terbantahkan.
Rakyat yakin Marsilio lah yang berdaulat. Berdaulat berdasarkan penunjukan Tuhan. Oleh karena itu, gagasan tentang hak ketuhanan rakyat, Â bertentangan dengan hak ketuhanan raja, bahkan dapat dicetuskan . Sebagai orang yang berdaulat, rakyat memilih seorang penguasa, mereka memberikan pemerintahan kepada diri mereka sendiri, namun dengan tindakan itu mereka tidak menyerah, melepaskan atau mengalihkan kedaulatan; Ini masih milikmu.
Teori Marsilio adalah teori kedaulatan rakyat yang menurun. Di dalamnya penguasa tidak lebih dan tidak kurang dari seorang wakil sederhana. Seseorang yang mempunyai tugas, perintah, amanah yang harus dipenuhi.
Ide-ide ini dikembangkan dalam karya paling terkenal  dan mungkin yang paling penting dari pemikir ini  berjudul Defensor pacis (1324). Dapat dikatakan karya ini memindahkan hubungan antara iman dan akal budi ke tingkat politik-sosial. Hubungan yang di kalangan Marsilio selalu mengutamakan keutamaan nalar di atas keimanan.
Defensor pacis ( Pembela Perdamaian ) mempunyai visi teleologis ganda, bisa dikatakan. Hal ini mengarah pada pembentukan teleologi tertinggi, transenden jika Anda mau, dan teleologi duniawi dan temporal lainnya. Gereja harus menangani teleologi transenden mengingat kepentingannya adalah mempersiapkan manusia untuk takdir kekal. Namun, itu bukanlah satu-satunya tujuan yang patut diapresiasi. Teleologi lainnya, duniawi dan terkini, memiliki makna dan tempat dalam kehidupan manusia. Ialah yang menjadi pedoman bagi umat manusia dan memberi cakrawala bagi kehidupan bersama yang kita sebut masyarakat.
Dualitas teleologis Marsilio menghasilkan dualitas kekuasaan boleh dikatakan. Yang satu adalah kekuatan spiritual dan yang lainnya adalah kekuatan duniawi. Keduanya tampaknya perlu. Keduanya bisa hidup berdampingan. Yang tidak boleh terjadi adalah salah satu pihak berusaha menundukkan pihak lain atau menganggap dirinya lebih unggul atau lebih mendesak dibandingkan pihak lain.
Gereja, hierarkinya, dan pesannya merupakan suatu kekuatan, otoritas, yang melayani tujuan tertinggi dan transenden yaitu persekutuan dengan Tuhan. Pemerintah sebagai aparat administrasi dan peradilan berorientasi pada tujuan-tujuan yang dikejar manusia di dunia ini, dalam kehidupan ini, di sini dan saat ini.