Pejabat intelijen AS sangat bersemangat dengan misi mereka sehingga mereka berusaha keras untuk melindungi rekrutan mereka dari penyelidik kriminal di Departemen Kehakiman AS. Kasus yang lebih tercela melibatkan peneliti aeronautika Nazi Emil Salmon, yang membantu membakar sinagog yang dipenuhi wanita dan anak-anak Yahudi selama perang. Salmon dilindungi oleh pejabat AS di Pangkalan Angkatan Udara Wright di Ohio setelah dinyatakan bersalah oleh pengadilan denazifikasi di Jerman.
Nazi bukan satu-satunya ilmuwan yang dicari oleh badan intelijen AS setelah berakhirnya Perang Dunia II. Di Jepang, Angkatan Darat AS mempekerjakan Dr. Shiro Ishii, kepala unit biowarfare Tentara Kekaisaran Jepang, gajinya. dr Ishii telah menggunakan berbagai agen biologi dan kimia untuk melawan pasukan China dan Sekutu dan mengoperasikan pusat penelitian besar di Manchuria, melakukan percobaan bioweapons pada tawanan perang China, Rusia, dan Amerika. Ishii menginfeksi tahanan dengan tetanus; memberi mereka tomat bertali tifoid; mengembangkan kutu yang terserang wabah; wanita yang terinfeksi sifilis; dan bom dengan daya ledak tinggi meledak di atas lusinan tawanan perang yang diikat ke tiang pancang. Catatan Ishii menunjukkan, antara lain, Â dia sering "
Di bawah ketentuan Paperclip, ada persaingan sengit tidak hanya antara Sekutu masa perang, tetapi  antara berbagai layanan AS - selalu merupakan bentuk pertempuran paling sengit. Curtis LeMay tentu melihat kepunahan virtual Angkatan Laut di Angkatan Udara AS yang baru dibentuknya dan berpikir proses ini akan dipercepat jika dia dapat menarik sebanyak mungkin ilmuwan dan insinyur Jerman. Angkatan Laut AS  berniat menangkap penjahat perang. Salah satu orang pertama yang ditangkap Angkatan Laut adalah seorang ilmuwan Nazi bernama Theordore Benzinger. Benzinger adalah seorang ahli luka di medan perang, keahlian yang diperolehnya melalui percobaan eksplosif pada subyek manusia selama tahap penurunan Perang Dunia II.
Melalui misi teknisnya di Eropa, Angkatan Laut  berada di jalur penelitian Nazi yang canggih di bidang teknik interogasi. Agen intelijen Angkatan Laut segera menemukan makalah penelitian Nazi tentang serum kebenaran. Investigasi ini dilakukan oleh Dr. Kurt Plotner dilakukan di kamp konsentrasi Dachau. Plotner telah memberikan mescaline dosis tinggi kepada tahanan Yahudi dan Rusia dan mengamati mereka menunjukkan perilaku skizofrenia. Para tahanan mulai berbicara secara terbuka tentang kebencian mereka terhadap para penculik Jerman mereka dan membuat pernyataan sektarian tentang keadaan psikologis mereka.
Pejabat intelijen America menyimpan minat profesional pada laporan. Proyek OSS Manhattan, Intelijen Angkatan Laut, dan personel keamanan telah lama melakukan penyelidikan sendiri terhadap apa yang disebut TD, atau "narkoba sejati". Seperti yang terlihat dari deskripsi tentang penggunaan THC oleh petugas OSS George Hunter White pada Mafioso Augusto Del Gracio, mereka bereksperimen dengan TD mulai tahun 1942. Beberapa subjek pertama adalah orang yang bekerja di Proyek Manhattan. Dosis THC diberikan ke target dalam Proyek Manhattan dengan berbagai cara, dengan larutan THC cair yang disuntikkan ke dalam makanan dan minuman atau dijenuhkan di atas tisu. "
Tapi ada masalah. Dosis THC membuat subjek melonjak, dan interogator tidak pernah bisa membuat ilmuwan membocorkan informasi, bahkan dengan tambahan konsentrasi obat.
Dalam Laporan Dr. Plotner menemukan kepada Petugas Intelijen Angkatan Laut AS  dia telah bereksperimen dengan mescaline sebagai bahasa dan bahkan obat pemberi kebenaran. Jadi, para interogator "dapat mengekstraksi bahkan rahasia paling intim dari subjek jika pertanyaan yang diajukan dengan tersingkap." Plotner  melaporkan potensi mescaline sebagai agen modifikasi perilaku atau pengendali pikiran.
Informasi ini sangat menarik bagi Boris Pash, salah satu karakter CIA yang lebih jahat di awal ini. Pash adalah seorang emigran Rusia ke Amerika Serikat yang telah hidup selama tahun-tahun evolusi kelahiran Uni Soviet. Dia akhirnya bekerja untuk OSS selama Perang Dunia II, mengawasi keamanan Proyek Manhattan, di mana, antara lain, dia mengawasi penyelidikan Robert Oppenheimer dan menjadi narasumber utama ilmuwan nuklir terkenal ketika yang terakhir dikelola menemukan rahasia di Uni Soviet.
Dalam posisinya sebagai kepala keamanan, Pash telah mengawasi penggunaan THC pada para ilmuwan di Proyek Manhattan milik George Hunter White. Pada tahun 1944, Pash dipilih oleh Donovan untuk mengepalai apa yang disebut misi Alsos, yang seharusnya menciptakan ilmuwan Jerman yang terlibat dalam penelitian senjata nuklir, kimia, dan biologi. Pash dibuka di rumah mantan kenalan sebelum perang Dr. Eugene von Haagen, profesor di Universitas Strasbourg, tempat banyak ilmuwan Nazi menjadi anggota fakultas. Pash telah bertemu von Haagen ketika dokter sedang melakukan cuti panjang di Universitas Rockefeller di New York, mempelajari tropis virus. Ketika von Haagen kembali ke Jerman pada akhir tahun 1930-an, dia dan Kurt Blome menjadi kepala bersama Divisi Bioweapons Nazi.Von Haagen menghabiskan sebagian besar pertempuran dengan menginfeksi orang Yahudi di kamp konsentrasi Natzweiler dengan penyakit termasuk demam berbintik. Tidak terpengaruh oleh aktivitas perang, teman lamanya, Pash segera mempekerjakan von Haagen dalam program Paperclip, di mana dia bekerja untuk pemerintah AS selama lima tahun, memberikan keahlian dalam penelitian senjata kuman.
Von Haagen menghubungkan Pash dengan mantan rekannya Blome, yang  dengan cepat diterima dalam program Paperclip. Ada jeda yang tidak nyaman ketika Blome ditangkap dan diadili di Nuremberg atas kejahatan perang medis, termasuk dengan sengaja menginfeksi ratusan tahanan bawah tanah Polandia dengan TBC dan wabah pes. Untungnya bagi orang sains Nazi, bagaimanapun, Intelijen Angkatan Darat AS dan OSS menahan dokumen memberatkan yang diperoleh melalui interogasi mereka. Bukti tidak hanya membuktikan kesalahan Blome, tetapi  peran utamanya dalam membangun laboratorium CBW Jerman untuk menguji senjata kimia dan biologi untuk digunakan dengan pasukan Sekutu. Blom keluar.
Pada tahun 1954, dua bulan setelah Blome dibebaskan, badan intelijen AS pergi ke Jerman untuk mewawancarainya. Dalam memo kepada atasannya, HW Batchelor menjelaskan tujuan ziarah ini: "Kami punya teman di Jerman, teman ilmiah, dan ini kesempatan untuk betemu mereka untuk membicarakan berbagai masalah kami." Pada pertemuan tersebut, Blome Batchelor memberikan daftar peneliti bioweapons yang telah bekerja untuknya selama perang dan membicarakan jalan baru yang menjanjikan untuk penelitian senjata pemusnah massal. Blome segera menandatangani kontrak kertas klip baru senilai $6.000 per tahun dan terbang ke America Serikat, di mana dia bertugas di Camp King, pangkalan Angkatan Darat di luar Washington, DC. Pada tahun 1951 oleh Haagen diambil alih oleh otoritas Prancis dari Haagen.Terlepas dari upaya tak kenal lelah dari para pelindung Dinas Rahasia AS, dokter itu dijatuhi hukuman dua puluh tahun penjara karena kejahatan perang.
