"Thetan" adalah kata yang ditemukan oleh Hubbard dan berasal dari huruf Yunani "" ("theta"). Itu sesuai dengan jiwa atau roh manusia, mewujudkan kebaikan primal, mahatahu, inti non-materi dari kreativitas manusia. Thetan dilihat oleh Scientology sebagai abadi dan, seperti dalam Buddhisme, setelah kematian meninggalkan tubuh fana dan mencari cangkang baru. Menurut Hubbard, thetan dapat bersemayam baik di dalam manusia (lebih tepatnya: di dalam kepala) maupun di luar tubuh manusia. Namun, dia tetap berhubungan dengan tubuh secara konstan dan mengendalikannya.
Pikiran manusia seperti database besar untuk Scientology. Tidak hanya semua pengalaman hidup seseorang yang tercatat dalam database ini, namun catatan ini kembali sejauh 350 miliar tahun. Untuk kehidupan awal thetan  dicatat. Pikiran, bagi Hubbard, hanyalah boneka bagi thetan untuk mengendalikan tubuhnya. Menurut Hubbard, pikiran dapat dibagi menjadi pikiran "analitik" dan "reaktif", dengan pikiran "analitik" mewakili pikiran yang sempurna, berpotensi habis sama sekali, tetapi pikiran "reaktif" mewakili apa yang disebut "engrams" , pengalaman traumatis , diblokir, yang menghambat kesuksesan manusia.
Tubuh hanyalah "mesin karbon-oksigen" untuk Hubbard. Dia menulis sedikit tentang dia. Dalam Dianetics dia hanya menyebutkan  mesin ini bekerja paling baik pada suhu 37C dan berfungsi sebagai aksesori fisik thetan. Thetan dikenali melalui tubuh dan dapat digunakan sebagai pusat komunikasi.
Selanjutnya, Hubbard membagi umat manusia menjadi kepribadian "sosial" (sekitar 80% umat manusia) dan "antisosial" (sekitar 20% umat manusia, contoh: Adolf Hitler, pengedar narkoba). Orang sosial memiliki kemampuan untuk melepaskan thetans mereka, sehingga mereka secara teoritis dapat didakwahkan oleh organisasi Scientology; tidak demikian halnya dengan kepribadian antisosial. Orang-orang antisosial harus dihancurkan karena mereka berkontribusi pada akhir kemanusiaan, tulis Hubbard.
Scientology berulang kali dituduh oleh lawan  praktik yang digunakan untuk membujuk anggota baru jauh melampaui manipulasi sederhana dan mewakili cuci otak langsung. Nyatanya, Scientology mengembangkan berbagai teknik untuk memulihkan manusia super thetan dan apa yang disebut "kemampuan asli". Untuk mencapai kemampuan ini, orang tersebut pertama-tama harus naik dari level preclear ke clear. Jana Jacobi, yang keluar dari Scientology, menggambarkannya seperti ini: "Yang jelas adalah seseorang yang telah membersihkan bank reaktifnya, yaitu sepenuhnya menghapus  perilakunya sepenuhnya rasional dan logis."
Sebuah teknik umum untuk mencapai hal ini adalah apa yang dikenal sebagai "Teknik Audit Dianetics" dimana seseorang dapat dimurnikan baik secara fisik maupun spiritual. Sebuah "E-Meter" digunakan untuk memfilter properti yang perlu dikerjakan. "E-Meter" adalah mesin yang bekerja seperti pendeteksi kebohongan dan menunjukkan di mana ada yang salah dengan "preclear", yaitu sesuatu yang traumatis atau tidak bermoral. Ini diukur menggunakan medan statis yang mengelilingi tubuh.
Metode ini, yang mirip dengan seminar psikoanalitik radikal, dijelaskan oleh sumber-sumber kritis dan laporan resmi sebagai sangat berbahaya. Pada sesi seperti itu, Scientology menjanjikan kliennya kekuatan, kesuksesan, karier, dan bahkan keabadian jika mereka berhasil berubah sesuai ajaran. Namun, tujuan dari teknik ini bukanlah untuk memenuhi keinginan pelanggan, tetapi untuk mendapatkan kekuasaan bagi organisasi Scientology melalui perbudakan pelanggan. Di sini cara berpikir yang tidak sesuai dengan Scientology sengaja dinyatakan salah dan direstrukturisasi.
Begitu seseorang berhasil menjadi "Jelas", mereka dapat mencapai delapan tingkat skala  yang berbeda, yang menjadikan mereka "thetan yang beroperasi bebas" yang kemudian tidak lagi terikat oleh materi, waktu dan ruang. Ada cara tetap untuk melakukan ini, seperti menjadi "Jelas". Apa yang disebut pencapaian didokumentasikan dalam statistik yang menunjukkan berapa banyak uang dan kekuasaan yang telah dihasilkan sejak bergabung dengan organisasi Scientology. Teknik canggih untuk mengubah orang dengan sengaja ini dipandang oleh banyak orang sebagai cuci otak. Karena Scientology mencoba membentuk orang menurut pandangan dunia Hubbard dan memberi tahu mereka kualitas mana yang diinginkan dan mana yang tidak.
Dalam tulisan-tulisan Hubbard, misalnya, kedermawanan atau solidaritas dipandang sebagai kelemahan dan ciri khas orang-orang yang kalah. Selain itu, istilah-istilah seperti "komitmen sosial" dan "amal" yang ada di gereja Kristen adalah asing bagi Gereja Scientology. Ini lebih tentang uang daripada agama. Hal ini memperjelas  Scientology  merupakan agama para serakah yang ingin menjadi sukses dan kaya melalui agama. Jadi Scientology dapat digambarkan sebagai agama para pemenang di mana kelemahan tidak memiliki tempat.
Tetapi bahkan para pemenang akhirnya kalah dengan Scientology, karena mereka menjadi budak sekte jika mereka tidak berhasil keluar tepat waktu. Psikoteknik Scientological dan manipulasi jiwa membuat mereka kecanduan tanpa disadari oleh para korban. Banyak putus sekolah Scientology mengkonfirmasi  kehidupan berubah secara radikal ketika mereka bergabung dengan sekte tersebut. Mereka tiba-tiba ada di dunia paralel di mana orang yang sama hidup, tetapi aturan yang sama sekali berbeda berlaku. Para pemula harus menjadi orang yang sama sekali berbeda untuk menjadi "jelas". Dalam Scientology, jalan untuk menjadi "thetan yang beroperasi secara bebas" hanya dapat dicapai melalui seminar mahal (kadang-kadang hingga $50.000 untuk seluruh hierarki Scientology ke-40) dan konsultasi. Banyak korban menghabiskan seluruh kekayaan mereka dan terlilit hutang besar.
Keluar dari sekte seringkali tidak mungkin, mantan anggota yang telah menentang Scientology dikirim ke "kamp pelatihan" di mana mereka diintegrasikan kembali dalam kondisi yang tidak manusiawi atau menghilang tanpa jejak. Orang putus sekolah yang berhasil terlepas dari segalanya, seperti Norbert Potthoff atau J. Jacobi, seringkali tidak hanya kehilangan tahun-tahun di mana mereka hanya hidup untuk sekte tersebut, tetapi mereka sering kali benar-benar melarat. Selain itu, mereka terus dilecehkan atau dilecehkan oleh Scientology.
