Kejahatan metafisik melibatkan gagasan bahwa hanya Tuhan yang sempurna. Oleh karena itu Leibniz menyebutnya monas monadum, monad  dari monad atau kesatuan asli, yang berdiri di atas semua monad atau unit lain yang ada. Dia sebagai substansi asli saja yang memiliki dalam segala kesempurnaan semua atribut yang padanya
totalitas monad. Oleh karena itu, tidak mungkin bagi Tuhan untuk menciptakan makhluk-makhluknya dengan sempurna, karena jika tidak, mereka akan menjadi dewa yang identitasnya sesuai dengan identitas Yahweh.
Oleh karena itu, Tuhan hanya dapat menciptakan makhluk yang relatif terbatas, kurang sempurna dari miliknya, tetapi mampu terus meningkat dan berjuang untuk kesempurnaan. Menurut Leibniz, sebagian dari penderitaan atau kejahatan di bumi diakibatkan oleh fakta bahwa dunia sengaja dibuat tidak sempurna.
Konsekuensi dari kejahatan metafisik adalah malum physicum atau kejahatan alam, yang teorinya telah didukung oleh Agustinus dari Hippo sebelum Leibniz melengkapinya dengan tesisnya tentang malum metafisika dan moral.
Jika seseorang berasumsi - seperti yang dijelaskan di atas  secara metafisik bahwa ciptaan Tuhan pasti tidak sempurna, ini  sejalan dengan ketidaksempurnaan fisik atau alam itu sendiri, yang akibatnya adalah penyakit, kesakitan, penderitaan dan kematian, serta kelainan bentuk dan bencana alam.
Melalui "estetika, pedagogisasi dan instrumentalisasi kejahatan" , namun sisi positifnya  dapat diperoleh. "Sesuatu yang asam, pedas, atau pahit sering kali lebih enak daripada gula; bayangan membuat warna lebih menonjol dan bahkan disonansi di tempat yang tepat meningkatkan harmoni";
Jadi, di satu sisi, penderitaan diperlukan untuk mengalami kebahagiaan. Misalnya, jika orang miskin menemukan uang kertas lima euro di jalan, mereka merasakan perasaan bahagia yang berbeda atau jauh lebih kuat daripada seorang jutawan, karena keduanya memiliki sejarah yang berbeda dan dengan demikian memiliki persepsi yang berbeda tentang uang.
Oleh karena itu, malum phycum tidak hanya menyiratkan pengalaman yang menyakitkan, tetapi  pengalaman yang positif. Biasanya kejahatan fisik memunculkan kejahatan moral, yang dianggap Leibniz sebagai yang paling serius dari tiga mala. Karena setiap manusia diberkahi dengan moral, ini memungkinkannya untuk melihat kejahatan dan kebaikan. Karena kebebasan kehendak yang diberikan Tuhan kepada manusia, mereka  memiliki otonomi untuk membuat keputusan atau melakukan tindakan yang menyebabkan penderitaan atau kejahatan. karena itu dapat berbuat dosa.
Menurut Leibniz, atribut berharga ini  kebebasan manusia  hanya dapat dicegah jika Tuhan telah menolak kualitas ini sejak awal. Pada saat yang sama, penghapusan kejahatan moral yang berprinsip mengakhiri kebebasan manusia. Tuhan bertemu umat manusia dan memberi mereka kebebasan yang datang sebagai akibat dari penderitaan dan kejahatan.
