Dengan karyanya pada Generasi Spontan Pasteur sepenuhnya memasuki dunia mikroorganisme. Seorang pria seperti dia, yakin  eksperimen adalah satu-satunya suara yang dapat diandalkan dari seorang ilmuwan, tidak memiliki pilihan lain untuk membuktikan tidak adanya apa yang disebut Generasi Spontan selain melalui eksperimen.Â
Setelah serangkaian pengalaman yang panjang, ia mempresentasikan pada tahun 1864 pada malam ilmiah di Sorbonne konferensinya yang terkenal tentang Generasi Spontan, di mana ia membantah argumen yang membuat teori berlindung pada mikroorganisme yang, sejak zaman Yunani, telah hadir dalam genesis makhluk hidup.
Setelah pekerjaan kristalografinya, pengalamannya dengan Fermentasi atau pelecehan dan penghancuran teori Generasi Spontan, Pasteur tidak hanya mendekati dunia ilmu kehidupan, tetapi  membuka pintu ke dunia yang sama sekali tidak dikenal sampai saat itu, yaitu Mikrobiologi.Â
Dari pengalamannya dengan mikroorganisme, ia memperoleh serangkaian kebiasaan yang penting dalam terjunnya ke Kedokteran.
Asepsis dipahami sebagai seperangkat cara yang bertujuan untuk menghindari kontaminasi oleh agen infeksi. Ketika meneliti dengan mikroorganisme, protokol kerja dikembangkan yang memberikan penekanan khusus pada menghindari kontaminasi kultur mikroba, jika tidak, tidak mungkin untuk memanipulasi populasi tertentu dari makhluk mikroskopis.Â
Oleh karena itu, tidak mengherankan jika Pasteur mengembangkan teknik penanganan yang dapat dianggap sebagai praktik aseptik.
Kedokteran pada abad ke-19 jauh dari praktik medis di zaman kita. Kamar rumah sakit adalah tempat bau di mana pasien dirawat tanpa kondisi kebersihan minimum, ruang di mana otopsi dilakukan berdekatan dengan ruang operasi improvisasi, penerangan yang buruk, dan perban yang digunakan kembali untuk menutupi luka adalah sisa-sisa pakaian lama atau seprai kotor. .Â
Alat bedah dulunya adalah milik ahli bedah, yang menyimpannya di saku mereka atau menahannya di antara gigi mereka di tengah prosedur.
Dokter tidak hanya tidak menjaga kebersihan pribadinya antara operasi dan pembedahan, bahkan menolak untuk mencuci tangan, tetapi  memuliakan jumlah kotoran pada pakaiannya karena ini adalah bukti kemampuan dan keahlian profesionalnya; tangan yang sama yang memanipulasi mayat diperkenalkan beberapa waktu kemudian di perut di meja operasi.Â
"Pada abad ke-19, menusuk diri sendiri dengan peniti membuka pintu kematian." Intervensi apa pun, betapa pun sederhananya, memicu serangkaian infeksi sekunder yang tak terhindarkan menyebabkan kematian; jangan katakan apa-apa tentang operasi bedah yang lebih berdarah seperti amputasi atau intervensi perut di mana tangan dokter menembus langsung ke lingkungan internal.
Pada tahun 1846 Ignc Semmelweis, seorang ahli bedah muda Hungaria yang lahir pada tahun 1818, mulai bekerja sebagai asisten di Rumah Sakit Umum Wina.Â