Memang, untuk menunjukkan keberadaan proses generatif bahasa, Chomsky melanjutkan dengan abstraksi dari aspek faktual bahasa dan bukan dari data neurobiologis. Noam Chomsky dan sekolahnya menunjukkan  sintaksis bahasa manusia mengikuti aturan mereka sendiri. Hukum sintaksis jelas bukan hukum biologis.
Pada konsep ini Chomski  mengasumsikan ekspresi neurobiologis langsung, ada kemungkinan lain yang lebih canggih. Orang dapat mengira  dukungan neurobiologis yang memungkinkan munculnya bahasa memang ditentukan secara biologis (dan dengan demikian bawaan), tetapi, terlebih lagi, dari dukungan ini, bahasa dan sintaksisnya memiliki otonomi; yang menyiratkan  mereka memiliki struktur mereka sendiri. Namun, bagi kami tampaknya inilah yang ditunjukkan Chomsky dan sekolahnya: sintaksis bahasa manusia mengikuti aturan mereka sendiri.
Karya Chomsky dapat menjadi bagian dari hipotesis otonomi kapasitas bahasa manusia dan oleh karena itu tampaknya tidak sah untuk membuat hipotesis  proses pembentukan bahasa yang diucapkan Chomsky sesuai dengan kapasitas yang muncul* dalam diri manusia.Â
Ini tidak bertentangan dengan hipotesis organisasi neurobiologis yang menyukai bahasa, tetapi menambahkan sebagai hipotesis tambahan , dari konfigurasi bawaan ini, tingkat organisasi yang lebih tinggi dibuat dan pada tingkat inilah struktur terungkap oleh karya linguistik yang dihasilkan.
Namun, otonomi tidak berarti kemerdekaan penuh. Kekhususan fakultas bahasa tidak mencegahnya untuk dikaitkan dengan kemampuan kognitif lainnya. Jika otonomi bahasa ada, itu relatif dan Noam Chomsky cenderung terlalu menonjolkannya dengan tidak memperhitungkan semantik yang menghubungkan bahasa dengan konseptualisasiÂ
Akhirnya bagi Noam Chomsky, pikiran adalah fungsi utama bahasa, jauh sebelum komunikasi. Tidaklah dilarang untuk menganggap  mekanisme generatif bahasa bercampur erat dengan proses kognitif murni, sehingga apa yang umumnya disebut pemikiran adalah hasil dari asosiasi keduanya. Aktivitas berpikir pada dasarnya akan didasarkan pada suatu genesis ganda, baik kognitif maupun linguistik.
Terima kasih.Â