Tetapi ini adalah mutasi yang diperlukan untuk mengubah rencana tubuh. Namun, para evolusionis selama beberapa dekade telah mempelajari mutasi yang salah. Mereka yang berurusan dengan gen struktural, evolusi mikro, hanya berurusan dengan bagaimana organisme bertahan hidup sebagaimana adanya, itu tidak memberi tahu kita bagaimana mereka menjadi seperti itu. Pertimbangkan kutipan berikut:
Sintesis Modern adalah pencapaian yang luar biasa. Namun, mulai tahun 1970-an, banyak ahli biologi mulai mempertanyakan kecukupannya dalam menjelaskan evolusi. ... Microevolution melihat adaptasi yang hanya menyangkut kelangsungan hidup yang terkuat, bukan kedatangan yang terkuat.
Dalam pendekatan eksplisit perkembangannya jelas  banyak perubahan yang terlambat tidak dapat diakumulasikan untuk memberikan yang lebih awal. Jadi, jika organisme yang jauh taksonomi berbeda segera kembali ke embriogenesis awal mereka, seperti yang sering terjadi, mutasi yang terlibat dalam divergensi evolusi mereka tidak melibatkan gen yang sama dengan yang terlibat dalam peristiwa spesiasi tipikal.
Untuk menyimpulkan dilema kita saat ini, perubahan morfologis yang signifikan membutuhkan mutasi perkembangan awal. Tetapi mutasi ini hampir secara universal tidak menguntungkan. Dan evolusi mikro, meskipun keberadaannya dalam buku teks sebagai bukti evolusi, sebenarnya memberi tahu kita sedikit berharga tentang proses evolusi. Jika mutasi perkembangan ini yang dapat menawarkan manfaat aktual sangat langka, maka evolusi makro diharapkan menjadi proses yang lambat dan sulit, namun bergelombang. Memang Darwin berharap  "seleksi alam bertindak hanya dengan mengumpulkan variasi yang sedikit, berturut-turut, menguntungkan, ia tidak dapat menghasilkan modifikasi besar atau tiba-tiba; itu hanya bisa bertindak dalam langkah-langkah pendek dan lambat. "
Asal usul rencana tubuh terbungkus dalam bukti paleontologi, fosil dan biologi perkembangan. Apa yang dikatakan catatan fosil tentang asal usul rencana tubuh dasar; Â Ketika kita mencari fosil yang menunjukkan proses bertahap yang lambat dari Darwin, kita sangat kecewa. Ledakan Kambrium terus membingungkan dan membuat penasaran. Ledakan Kambrium terjadi sekitar 543 juta tahun yang lalu menurut ahli paleontologi. Hanya dalam waktu beberapa juta tahun, hampir semua filum hewan muncul pertama kali. Kemunculan tiba-tiba ini tanpa bukti keturunan pada periode sebelumnya. S. Conway Morris menjelaskan:
Istilah "ledakan" tidak boleh dianggap terlalu harfiah, tetapi dalam hal evolusi itu masih sangat dramatis. Artinya adalah diversifikasi cepat kehidupan hewan. "Cepat" dalam hal ini berarti beberapa juta tahun, bukan puluhan atau bahkan ratusan juta tahun yang lebih khas. . .
Sebelum Kambria, (550-485 juta tahun lalu), selama Vendian (620-550 juta tahun lalu) Â menemukan bukti fosil untuk spons sederhana, mungkin beberapa cnidaria dan kumpulan Ediacaran yang penuh teka-teki. Sebagian besar kami hanya menemukan organisme sel tunggal seperti bakteri, cyanobacteria, ganggang, dan protozoa. Tiba-tiba, dalam ledakan Kambrium (545-535 juta tahun yang lalu), kita menemukan spons, cnidaria, platyhelminthes, ctenophores, moluska, annelida, chordata (bahkan ikan primitif), dan echinodermata.
Sementara banyak filum hewan tidak ada di Kambrium, absen itu sebagian besar filum dari beberapa anggota dan tidak mungkin menjadi fosil dalam kondisi ini. James Valentine melangkah lebih jauh dengan mengatakan  "keragaman rencana tubuh yang ditunjukkan dengan menggabungkan semua sisa-sisa Kambrium Awal ini sangat besar. Menilai dari pohon filogenetik kehidupan, semua filum (hewan) yang hidup mungkin ada pada akhir interval ledakan. "Kemudian Valentine meyakinkan kita  catatan fosil dari periode ledakan sama baiknya atau lebih baik daripada bagian rata-rata dari kolom geologi. Jadi, kita tidak bisa menggunakan anggapan  rekaman fosil terlalu lengkap seperti yang dilakukan banyak evolusionis.
Dalam Ledakan Kambrium kita memiliki penampilan pertama dari sebagian besar rencana tubuh hewan. Ledakan rencana tubuh ini membutuhkan peningkatan kuantum informasi biologis. Diperlukan informasi dan regulasi genetik baru. Diperlukan mutasi pada tahap awal perkembangan embriologis dan harus terjadi dalam urutan api yang hampir cepat. Beberapa orang berpendapat  mungkin pengaturan genetik dari rencana tubuh lebih fleksibel saat itu, membuat lebih banyak eksperimen. Tetapi kami menemukan beberapa organisme yang sama di strata dari Cina ke Kanada dan selama periode ledakan. Organisme ini tidak menunjukkan bukti fleksibilitas bentuk yang lebih besar.
Tingkat mutasi jelas merupakan masalah. Susumo Ohno menunjukkan  "masih perlu 10 juta tahun untuk menjalani perubahan 1% dalam urutan basis DNA.  Munculnya hampir semua filum yang masih ada dari Kingdom Animalia dalam rentang waktu 6-10 juta tahun tidak mungkin dapat dijelaskan oleh divergensi mutasi fungsi gen individu. "
Darwinisme juga membutuhkan persamaan awal antara organisme dengan diversifikasi yang lambat. Phyla seharusnya hanya dikenali setelah mungkin ratusan juta tahun keturunan dengan modifikasi. Namun keragaman besar Ledakan Kambrium muncul pertama kali dengan melayang secara bertahap sesudahnya, kebalikan dari apa yang diprediksi evolusi. Lagi-lagi beberapa orang berpendapat  struktur genetik organisme purba kurang dibatasi dewasa ini sehingga memungkinkan mutasi perkembangan awal dengan hasil yang lebih ringan. Tetapi masih akan ada beberapa lintasan perkembangan yang akan ada; jadi keuntungan selektif dari mutasi harus lebih besar daripada gangguan jalur perkembangan yang sudah mapan.
