Setelah audiensi umum di Lapangan Santo Petrus pada 27 Februari 2013 dan audiensi selanjutnya pada 28 Februari, Benediktus XVI kembali ke Castel Gandolfo pada sore hari, di mana dia menunjukkan dirinya kepada umat beriman untuk terakhir kalinya sebagai Paus di sore hari.
Pada pukul 20:00 Waktu Vatikan, para pengawal Swiss menutup gerbang Istana Kepausan dan meninggalkan pos mereka, menandakan berakhirnya masa kepausan kepada publik.
Benediktus XVI disebut sebagai Paus Emeritus atau Roman Pontifex Maximus Emeritus (Summus Pontifex Emeritus), dipanggil sebagai Bapa Suci atau Yang Mulia. Namun, Benediktus sendiri ingin dipanggil sebagai Papa Benediktus. Ia juga tetap memakai jubah putih, tanpa pelegrina, tanpa cingulum, tanpa pileolus putih dan mengembalikan cincin nelayan resminya.
Pada tanggal 23 Maret 2013, Benediktus XVI menerima Paus Fransiskus di Castel Gandolfo untuk kunjungan pribadi. Ini adalah pertama kalinya dalam lebih dari 700 tahun seorang paus emeritus bertemu penggantinya di kantor. Paus Fransiskus  menunjuk dirinya sendiri dan Benediktus XVI sebagai saudara, dan keduanya berbagi bangku doa di sebuah kapel kecil.
Paus Emeritus bersumpah untuk taat dan setia tanpa syarat kepada penggantinya, Paus Fransiskus. Setelah area biara Mater Ecclesiae dengan taman seluas 2000 m2 diubah untuk menjadi kediamannya, Benediktus kembali ke Vatikan pada 2 Mei 2013, di mana ia disambut oleh Paus Fransiskus. Ia merayakan konsistori publik pertama penggantinya Paus Fransiskus pada 22 Februari 2014 di Basilika Santo Petrus.
Pada tanggal 4 Maret 2014, Paus Fransiskus memberikan wawancara di mana dia untuk pertama kalinya mengomentari secara rinci hubungan dengan pendahulunya, termasuk keputusan bersama bahwa Benediktus harus lebih berpartisipasi lagi dalam kehidupan gereja publik.
Pada bulan Maret 2014, harian Milan Corriere della Sera melakukan wawancara dengan Benediktus XVI. Pada 27 April 2014 ia menghadiri kanonisasi Paus Yohanes XXIII dan Yohanes Paulus II oleh Paus Fransiskus di Lapangan Santo Petrus dan juga dalam beatifikasi Paus Paulus VI.Â
Perpustakaan Romawi Joseph Ratzinger, Benedict XVI, di Pontifical Teutonic College diumumkan pada April 2015 dan dijadwalkan dibuka untuk para sarjana pada November 2015. Sedangkan bagian Perpustakaan yang didedikasikan untuk kehidupan dan pemikirannya sedang dikatalogkan. Hal itu termasuk buku oleh atau tentang dia dan studinya, banyak yang disumbangkan oleh Benediktus sendiri.
Pada bulan Juli 2018, publikasi Benediktus XVI diumumkan. Awalnya ditulis untuk penggunaan internal, buku berjudul Grace and Vocation without Remorse : Comments On The Treatise De Iudaeis - Â oleh: Benediktus XVI (klik di sini untuk baca)Â menimbulkan sensasi. Buku tersebut membahas hubungan antara gereja katolik dan yudaisme dan menjelaskan istilah teologi substitusi dan perjanjian yang tidak dibatalkan.
Dalam sebuah esai yang ditulis pada tahun 2019 di buku Des profondeurs de nos coeurs (Dari lubuk hati kami) oleh Kardinal Kuria Robert Sarah pada tahun 2020, diungkap bahwa tindakan Paus Emeritus Benediktus XVI sangat mementingkan selibat. Ini adalah prasyarat dasar agar iman kepada Tuhan tetap menjadi dasar kehidupan imamat. Bagi Paus Emeritus Benediktus, pengabdian seorang imam membutuhkan dedikasi total kepada Tuhan.
