Membunuh banyak orang demi menyelamatkan lebih banyak orang di masa depan adalah prinsip dari Shinta Himura.
Shinta Himura (Takeru Satoh) , adalah seorang samurai muda dengan kemampuan berpedang yang luar biasa, demi impiannya yang ingin membawa era baru dengan pedangnya, Himura bergabung dengan pasukan restorasi dibawah kepemimpinan Katsura Kogoro (Issey Takahashi) yang bertujuan menggulingkan kepemimpinan shogun.
Himura adalah samurai terkuat yang dimiliki pasukan restorasi, dengan jurus pedang dari aliran Hitenmitsurugi, dalam waktu singkat dia bisa mebunuh ratusan orang, inilah yang kemudian membuat Shinta Himura lebih dikenal sebagai “Hitokiri Battosai”.
Pasukan Restorasi yang Terdesak.
Diawal memang pasukan restorasi berhasil unggul, namun pasukan pendukung Shogun berhasil membalikan keadaan dengan adanya unit pasukan Shinseigumi yang beranggotakan para samurai hebat seperti Hajime Saito (Yosuke Eguchi) dan Seji Okita (Nijiro Murakami).
Pasukan restorasi terpaksa mundur dan bersembunyi sembari menunggu kesempatan untuk bisa kembali melawan pasukan pendukung Shogun. Himura yang merupakan kartu as pasukan restorasi juga harus ikut bersembunyi seperti rekan-rekan lainnya.
Dalam persembunyiannya, Himura berpura-pura menjadi seorang petani dan menjadi suami dari Tomoe Yukishiro (Kasumi Arimura).
Tomoe sebenarnya adalah seorang mata-mata, dia ditugaskan untuk mencari kelemahan Himura oleh pasukan pasukan pendukung Shogun, sehingga bisa membunuhnya, saat Himura tewas, maka pasukan restorasi bisa dikalahkan dengan mudah.
