KAI Commuter menjelaskan adanya perubahan rute KRL Commuterline di stasiun Manggarai. Dalam akun twitter resmi KAI Commuter dijelaskan bahwa pada Jumat 27 Mei 2022 malam hingga Sabtu 28 Mei 2022 dini hari akan dilakukan Switch Over (SO) ke-5 di Stasiun Manggarai. Switch Over ini dilakukan untuk menata dan mengkondisikan jalur kereta api di Stasiun Manggarai sehingga pembangunan akan dilanjutkan. Setelah SO 5 dilakukan, akan terjadi penyesuaian Grafik Perjalanan Kereta Api (GAPEKA) KRL Jabodetabek pada Line Bogor dan Line Cikarang.
Mulai 28 Mei 2022, KRL Line Bogor hanya menuju ke Stasiun Jakarta Kota sedangkan untuk KRL Line Cikarang menggunakan 2 pola operasi sebagai berikut:
1. Full Racket (Looping)
-Cikarang/Bekasi -- Jatinegara -- Manggarai -- Kampung Bandan -- Pasar Senen -- Jatinegara -- Bekasi/Cikarang
--Cikarang/Bekasi -- Jatinegara -- Pasar Senen -- Kampung Bandan -- Manggarai -- Jatinegara -- Bekasi/Cikarang
2. Half Racket
-Cikarang/Bekasi -- Jatinegara -- Manggarai -- Tanah Abang -- Kampung Bandan (PP)
--Cikarang/Bekasi -- Jatinegara -- Manggarai -- Tanah Abang -- Angke (PP)
Serpong Line, Tangerang Line dan KA Bandara Soetta tidak ada perubahan.
