Pesantren Fakultatif menyediakan layanan pendalaman ilmu-ilmu keislaman khusus, seperti Al-Quran, Figh, Bahasa Arab, atau yang lain, misalnya Ma'had Aly yang tersebar di seluruh Nusantara dengan fakultas yang variatif.
Selain itu, papar Ubaydillah, pesantrenku.com juga akan memberi layanan info beasiswa bagi santri, berita dan pemikiran terkini mengenai pesantren, panduan bagaimana mendirikan pesantren, kiprah santri, dan menyediakan ruang sosialisasi regulasi dan kebijakan pemerintah mengenai pesantren.
Untuk menjalankan program-programnya, pesantrenku.com diperkuat oleh sejumlah pakar dari para santri senior, di antaranya Dr. Amin Haedari (pakar pesantren dari PBNU), Dr. Yulizar Sanrego (pakar ekonomi pesantren), Dr. Ferry MS (dari Pesantren Scholarsip Centre), dan Moch. Husen Sanusi (pakar media online).
Menurut Kyai Imam Jazuli, hadirnya pesantrenku.com perlu dipahami juga sebagai langkah penting yang digagas Pesantren Bina Insan Mulia untuk mempertegas posisi pesantren yang sejak awal berdirinya Republik ini menjadi aset bangsa dan negara.
