secara umum metode pembelajaran yang diterapkan di pesantren mencakup dua aspek yaitu :
1. Metode yang bersifat tradisional atau salaf
Metode ini yaitu metode pembelajaran asli pondok pesantren. Seperti :
1. Metode sorogan, metode ini merupakan kegiatan pembelajaran para santri pada pengembangan kemampuan perseorang.
2. Pengkajian pasaran, metode ini merupakan kegiatan belajar para santri melalui pengkajian materi tertentu pada ada seorang kyai yang dilakukan secara terus-menerus selama waktu yang telah di tentukan.
3. Metode demonstrasi, metode ini merupakan cara pembelajaran memperagakan suatu gerakan atau kegiatan ibadah tertentu yang dilakukan secara perorangan atau kelompok di bawah petunjuk dan bimbingan kyai.
4. Metode muhawaroh, metode ini merupakan latihan bercakap dalam bahasa Arab atau bahasa Inggris.
5. metode riyadhoh, metode ini merupakan metode pembelajaran yang menekankan pada olah batin yang bertujuan untuk mensucikan hati.
2. Metode yang bersifat modern
metode ini merupakan metode pembaharuan hasil pembelajaran.
Poin-poin karakteristik pesantren diantaranya
1. Pondok pesantren
2. Masjid
3. Pengajaran kitab Islam klasik
4. Santri
5. Kyai