CRISPR: Potensi untuk Uji Deteksi Covid-19 yang Lebih Valid

CRISPR atau Clustered Regulary Interspaced Short Poliandromic Repeats (CRISPR) merupakan teknologi pengeditan genom di DNA yang memiliki karakteristik seperti adanya nukleotida repeats dan spacer. Genom repetisi tersebut diikuti oleh segmen pendek yang disebut DNA Spacer secara selang-seling, misalnya 40% genom bakteri dan 90% genom archaebacteria tersusun atas CRISPR. Gen CRISPR tersebut digunakan oleh prokariota sebagai sistem imun dari infeksi, konjugasi dan transformasi akibat serangan materi genetic asing. Repeats DNA memiliki 28-37 bp dan spacer mempunyai 32-38 bp.

Teknologi CRISPR juga memberikan bantuan selama pandemic SARS-COV-19. Teknologi yang sering digunakan saat ini seperti RT-PCR dan serologis memiliki akurasi dan sensitivitas kurang maksimal. RT-PCR yang dikembangkan oleh CDC pun memiliki tingkat negative palsu sekitar 30%. Metode serologis memiliki waktu jauh sembuh ceoat namun kurang untuk mendeteksi infeksi saluran pernapasan akut yang lebih spesifik, karena diperlukan waktu untuk antibodi dapat berkembang.

Crispr/Wikipedia

            Baru-baru ini, uji deteksi COVID-19 dengan SARS-COV-2 DETECTR berbasis CRISPR Cas12 telah dikembangkan. Teknologi ini dapat mendeteksi COVID-19 dengan waktu yang lebih singkat sekitar 40 menit dan akurasi 95%. Pengujian melibatkan ekstraksi RNA diikuti oleh transktipsi terbalik dan amplifikasi isothermal stimulant menggunakan metode RT-LAMP. Cas12 dan RNA pemandu terhadap daerah gen N (nukleoprotein) dan gen E (amplop) SARS-CoV-2 kemudian ditargetkan, yang dapat divisualisasikan dengan pembelahan molekul reporter fluoresen. Pengujian juga mencakup strip aliran laminar untuk pembacaan visual, probe fluoresen dan karenanya positif untuk SARS-CoV-2. Selain utilitas diagnostik CRISPR, CRISPR dapat memberikan opsi terapi untuk pasien COVID-19. Cas13 yang baru ditemukan adalah endonuklease penargetan RNA yang dipandu RNA yang dapat berfungsi sebagai alat terapi potensial melawan COVID-19. PAC-MAN (Prophylactic Antiviral CRISPR dalam sel manusia) telah dikembangkan, yang memanfaatkan varian VI-D CRISPR-Cas13d turunan Ruminococcus flavefaciens, dipilih karena ukurannya yang kecil memfasilitasi pengemasan yang lebih mudah dalam pembawa virus, spesifisitas tinggi, dan aktivitas katalitik yang kuat pada manusia sel. Teknik ini dikembangkan untuk secara simultan menargetkan beberapa wilayah untuk degradasi RNA, membuka pintu untuk strategi penargetan corona virus yang sangat dibutuhkan, mengingat bukti yang menunjukkan tingkat mutasi dan rekombinasi SARSCoV-2 yang relatif tinggi. Dengan kemajuan ini, mesin CRISPR/Cas dapat kembali diimplementasikan untuk memenuhi tujuan awalnya sebagai sistem memerangi virus untuk memberikan bantuan selama pandemi ini.

Sumber :

1