Itachi merupakan konspirasi di desa Konoha. Shinobi yang sangat cinta dengan kedamaian desa. Harus dihadapkan misi dengan pilihan yang berat, memilih desa atau klan/keluarga dari petinggi desa.
Akhirnya, ia lebih memilih desa dengan membantai klannya sendiri ditangannya. Karena klan Uchiha ditakutkan melakukan kudeta, ancaman besar bagi kedamaian desa. Sungguh pilihan dilematis buat sang Itachi.
Dengan berat ia meminta kepada petinggi berjanji menjaga adiknya Sasuke Uchiha dan merahasiakan peristiwa kelam yang dilakukan desa dan dirinya. Dan pergi dari desa, menyandang predikat buronan sang pembantai klan.
Kepergian Itachi dari desa tidak serta merta berkurangnya loyalitas kepada desa. Ia bergabung dengan organisasi terlarang Akatsuki. Dengan tujuan untuk melindungi desa dari Akatsuki, sebagai mata-mata Konoha.
Menjelang kematian ditangan Sasuke Uchiha, ia masih menurunkan kemampuan khususnya kepada sang adik. Sebagai bentuk rasa sayang kepada adik semata wayang.
Pada perang shinobi keempat, Itachi yang dibangkitkan dengan jutsu terlarang edotensei Kabuto. Justru bumerang bagi Kabuto sendiri, menjadikan kelemahan bagi pengguna jutsu endotensei. Membantu pasukan aliansi shinobi mematahkan jutsu merepotkan yang membuat pasukan kerepotan.
Kabuto Yakushi dan Orocimaru
Dua sosok shinobi yang mengerikan. Yang selalu melakukan banyak percobaan pada manusia. Untuk mengembangkan jutsu terlarang. Karakter jahat dari dua sosok ini lebih ketara dalam serial Naruto.Â
Namun pada ending cerita kedua tokoh berperan penting dalam membantu aliansi shinobi saat pertempuran. Kabuto membantu Sasuke ketika sekarat akibat tusukan Madara Uchiha. Dengan ninjustu medis yang ia miliki. Setelah tobat dari hebatnya jutsu Izanagi Itachi.Â
Di serial Boruto Next Generation, Kabuto menjadi pengasuh di panti asuhan di desa Konoha. Menebus kesalahan yang pernah ia lakukan.
Sedangkan Orochimaru berhasil membangkitkan empat hokage pendahulu, untuk bergabung membantu pasukan aliansi bertarung melawan Jubi, Madara dan Obito. Dan berhasil merubah keadaan perang menuju kemenangan.