Masjid UNEJ Kampus Bondowoso ini merupakan sebuah sarana bagi mahasiswa untuk melakukan ibadah kepada Tuhan. Masjid ini tidak juga digunakan hanya untuk melakukan ibadah saja tapi biasa digunakan untuk tempat bermusyawarah. Mahasiswa yang mengikuti ukm hadrah juga biasanya melakukan latihan di masjid tersebut.
Akan tetapi sekararang masjid UNEJ kampus Bondowoso tersebut tidak dapat digunakan sebagaimana mestinya dikarenakan adanya kerusakan pada beberapa bagian seperti atap yang bocor dan beberapa kerusakan lainnya meskipun usia masjid tersebut terbilang masih belum lama didirikan.
Menurut Pak Tamyiz selaku pengurus masjid, beliau berpendapat bahwasannya Masjid UNEJ kampus Bondowoso tersebut dapat rusak meskipun usianya terbilang masih belum lama didirikan dikarenakan mungkin terdapat material dalam pembangunan yang kurang bagus dan juga faktor lainnya kurangnya perawatan dalam menjaga Masjid UNEJ tersebut.Â
Sedangkan menurut salah satu Mahasiswa UNEJ berpendapat sebaliknya, bahwa masjid tersebut tidak akan direnovasi melainkan justru malah akan dibangun gedung baru. Dia juga berpendapat bahwa pembangunan gedung sebaiknya ditempatkan di area depan kampus, sehingga masjid tersebut tidak hanya digunakan oleh mahasiswa juga melainkan masyarakat sekitar kampus juga ikut menggunakan masjid tesebut sebagai sarana beribadah dan tempat beristirahat tentunya.
