Tujuan dilakukan audit internal  untuk mengetahui seberapa efektif penerapan sistem manajemen mutu ISO 9001:2015 di perusahaan. Melalui audit internal dapat dilakukan perbaikan bila ditemukan penyimpangan -penyimpangan terhadap penerapan standar ISO 9001:2015.
Pada prakteknya pelaksanaan audit mutu internal ISO kerap menemui kendala-kendala yang mengakibatkan sistem ISO berjalan tidak sebagaimana mestinya.
Dalam tulisan ini akan dibahas sejumlah kendal-kendala audit internal ISO yang antara lain sebagai berikut: