Dengan keterbatasan waktu, saya tidak sempat mengeksplorasi garis pantai yang melingkari pulau, yang pernah dihuni Suku Bajo, Bugis dan Makassar. Menurut seorang guide kami, Pak Bidu, Pulau Bokori pernah dihuni tiga suku yang terbagi dalam 6 wilayah selama puluhan tahun.
Karena pulau ini relatif kecil, maka ketika jumlah penduduknya terus bertambah, di tahun 1970an pemerintah memindahkan seluruh penduduknya ke seberang pulau. Seluruh penghuni Pulau Bokori dipindahkan dengan kompensasi setiap kepala keluarga mendapatkan rumah.