Ki Gendeng Pamungkas tidak setuju dengan anggota Komisi III DPR RI Ruhut Sitompul yang memberi pendapat bahwa Presiden Susilo Bambang Yudhoyono (SBY) tidak perlu turun tangan mengatasi pengepungan anggota Polri di Gedung Komisi Pemberantasan Korupsi (KPK) dengan alasan sudah cukup ditangani oleh Menteri Koordinator Politik Hukum dan Keamanan (Menkopolhukam).