Rumah Sakit Islam Klaten, awalnya merupakan BP (Balai Pengobatan) berdiri pada tahun 1981 di lantai dasar Masjid Raya Klaten. Setelah berkembang cukup baik, muncul ide dari YJHK (Yayasan Jama'ah Haji Klaten) untuk mengembangkan BP menjadi sebuah rumah sakit yang representatif. Pembangunan RSI Klaten dimulai tahun 1981.
Tanggal 19 September 1986, RSI Klaten mulai beroperasi, tanggal tersebut dijadikan sebagai kelahiran (milad) RS. Islam Klaten. Sambil terus berbenah melengkapi fasilitas dan peralatan, RSI Klaten siap diresmikan pada Jumat 8 Januari 1988 oleh Menteri Agama (H. Munawir Sadzali, MA), Duta besar Arab Saudi dan beberapa pejabat tinggi tingkat I dan II.
