Cuma, tidak semua area di kompleks Kelenteng Sam Poo Kong bebas dimasuki oleh wisatawan. Bangunan utama yang berupa kuil-kuil, merupakan tempat terlarang bagi wisatawan untuk memasukinya. Wisatawan boleh melihat hanya sebatas dari pintu luar kuil.
Setiap kuil, baik yang berukuran besar maupun kecil ada penjaganya. Bangunan itu bisa dimasuki bagi orang-orang yang mau melaksanakan persembahyangan sesuai ajaran agama Konghucu.
Bagi wisatawan yang beragama Islam, tidak perlu khawatir berada di kompleks Kelenteng Sam Poo Kong, dan tepat memasuki jam shalat wajib lima waktu. Di area kompleks tersebut, ada bangunan mushola walau ukurannya tidak terlalu besar namun cukup bersih dan terpelihara.