Namun seiring waktu, pengelolaan Gua Sunyaragi seperti tidak terurus. Fasilitas di panggung budaya banyak yang rusak. Area sekitar panggung budaya lebih banyak ditumbuhi ilalang.
Lebih parah lagi, Pujagalana yang sempat jadi tempat tongkrongan warga Cirebon hingga larut malam, lambat laun jadi sepi. Lama kelamaan, para pedagang di sana memilih cabut, tidak melanjutkan usaha.
Pujagalana jadi tempat yang tidak bertuan. Lokasi tersebut jadi tempat yang menyeramkan. Setelah rata dengan tanah, tumbuhlah pohon-pohon liar. Pengunjung pun jadi agak malas untuk datang ke sana.
Kini Gua Sunyaragi menampilkan wajah baru. Panggung budaya Gua Sunyaragi, asyik untuk nongkrong-nongkrong lagi. Dari situlah pintu masuk bagi wisatawan. Loket pembelian tiket masuk ada di sisi kiri.
Pada hari-hari biasa, pengunjung dikenakan harga tiket senilai Rp 10.000,00. Harga akan berubah di akhir pekan, menjadi Rp 20.000. Rombongan wisatawan juga bisa menggunakan jasa pemandu, dengan biaya Rp 50.000,00.
Kompleks Gua Sunyaragi selain dilengkapi panggung budaya, kini menambah fasilitas lainnya beruapa wahana flying fox dan sepeda gantung. Wahana ini jadi favorit wisatawan untuk berfoto ria.
