UNUSA awalnya didirikan pada 1979 dengan bantuan Yayasan Rumah Sakit Islam Surabaya (YARSIS). Pada awalnya nama YARSIS bukan UNUSA, melainkan Sekolah Kesehatan (SPK). Dengan berganti nama menjadi Sekolah Keperawatan YARSIS pada tahun 1985, perkembangan sekolah tahun 2006 yaitu AKPER-AKBID merupakan kesatuan organisasi. dari dua lembaga YARSIS. Ubah menjadi YARSIS STIKES. Sejak saat itu, YARSIS telah membuat lompatan besar dalam kemajuan dan terus berkembang, dan pada tahun 2012 menginisiasi proses hukum peralihan dari institusi menjadi DIKTI sebagai universitas. Akhirnya, sejarah mengalami lompatan besar, dan Universitas Nahdlatul Ulama Surabaya (UNUSA) didirikan di Surabaya.
Pada tahun 2020, UNUSA sendiri memiliki dua kampus yaitu Kampus A di Wonokromo Surabaya dan Kampus B di Jemursari Surabaya. Tak hanya itu, UNUSA juga didukung oleh laboratorium yang lengkap dan memiliki tiga rumah sakit yang siap beroperasi. Dalam proses perkembangannya, United Nations American University adalah universitas muda dengan prestasi yang membuahkan hasil. Visi UNUSA sendiri adalah menjadi institusi pendidikan tinggi profesional terkemuka di bidang IPTEKS atau IPSTEKS, dengan jiwa kewirausahaan dan jati diri Islam.