Pada saat erupsi Gunung Merapi pada tahun 2006 silam, tercatat ada dua korban yang terjebak di dalam bunker dan ditemukan tewas. Penyebab dua orang tewas di dalam bunker karena suhu udara yang sangat tinggi hingga 200 derajat Celcius pada saat erupsi terjadi. Sejak tragedi itu, Bunker Kaliadem tidak lagi difungsikan sebagai tempat berlindung saat erupsi terjadi. Penyebabnya karena tempat tersebut tidak aman untuk melindungi warga saat erupsi terjadi. Bahkan disebut risikonya sangat tinggi.