Lapas Magelang telah menjalin Kerjasama dengan Puskesmas Kerkopan dalam rangka Peningkatan Pelayanan Kesehatan bagi Warga Binaan melalui penandatanganan Perjanjian Kerjasama. Kerjasama ini dilaksanakan guna meningkatkan pelayanan kesehatan kepada Warga Binaan terutama dalam hal pemeriksaan kesehatan maupun tindakan medis dan juga tindak lanjut kepada Warga Binaan Lapas Magelang yang memerlukan rujukan.
Selain menjalin Kerjasama dengan Puskesmas Kerkopan, Klinik Pratama Lapas Magelang juga menjalin Kerjasama dengan Dinas Kesehatan Kota Magelang, Rumah Sakit Umum Tidar Magelang serta RSJ Prof. Dr. Soerojo Magelang. Kerjasama ini diharapkan dapat memberikan dampak positif di bidang Kesehatan terutama demi mewujudkan pelayanan kesehatan yang optimal bagi warga binaan.