1. Pesantren Salafiyah atau Tradisional
Pesantren Salafiyah ini merupakan pondok pesantren yang mengkaji tentang kitab-kitab kuning atau kuno. Pesantren Salafiyah tetap mempertahankan pelajaran kitab-kitab klasik tanpa diberikan pengetahuan umum. Pesantren Salafiyah identik dengan pesantren tradisional. Perbedaan pesantren tradisional dengan pesantren modern terletak dalam hal metode pembelajaran dan infastrukturnya. Kyai terjun langsung dalam menangani santrinya, sehingga hubungan keduanya cukup dekat secara emosional. Kegiatan dalam pondok salaf ini adalah
a. Mengaji kitab kuning
b. Pasaran di bulan romadhon
c. Melakukan sholat berjamaah
d. Mauludan
e. Ro'an atau kerja bakti di sekitar lingkungan pesantren.
Sistem pengajaran dalam pondok salafiyah ini ada wetonan dan sorogan.
2. Pesantren Khalafiyah atau Modern