Papua (d/h Papua Barat, kemudian disebut Irian Barat selanjutnyaIrian Jaya) kembali ke pangkuan ibu pertiwi berdasarkan Pepera (Penentuan Pendapat Rakyat), semacam referendum (menyerahkan penentuan tentang sesuatu kepada rakyat) tahun 1969. Nama Papua dikembalikan oleh Gus Dur semasa menjabat sebagai presiden.