Pemerintah Kota Jayapura sudah menerbitkan peraturan daerah (Perda) tentang Pencegahan dan Penanggulangan Infeksi Menular Seksual, Human Immunodeficiency Virus dan Acquired Immune Deficiency Syndrome melalui Perda No 7 Tahun 2006 yang disahkan tanggal 12 Oktober 2006. Tapi, Dinas Kesehatan (Dinkes) Kota mewacanakan perlunya Kota Jayapura memiliki Perda tentang upaya pencegahan dan penanggulangan HIV-AIDS (Dinkes Kota Wacanakan Perda Penanggulangan HIV-AIDS, www.cenderawasihpos.com, 9/5-2011).
