Pondok Pesantren Tahfidz Darul Mujahidah membangun program mengaji yang holistik untuk membimbing anak-anak dalam memahami ajaran Islam. Fokus utama program ini melibatkan pembelajaran praktek sholat, tajwid, dan penghafalan Al-Qur'an.
Anak-anak diajak untuk memahami esensi sholat dengan praktek langsung, menumbuhkan kedisiplinan dan konsentrasi. Program tajwid ditekankan untuk memastikan pembacaan Al-Qur'an dilakukan dengan benar, menanamkan keindahan dalam setiap huruf yang terucap.