Salah satu mata pelajaran SMK yang terancam dihapus dengan diberlakukannya K-13 adalah pelajaran IPA (Ilmu Pengetahuan Alam). Tidak seperti hebohnya mata pelajaran TIK atau KKPI yang terancam hilang dengan adanya K-13, pemberitaan mengenai mata pelajaran IPA cenderung tenang-tenang saja. Padahal jumlah guru yang terancam hilang kesempatannya mengajar jumlahnya juga hampir menyamai mata pelajaran KKPI di tingkat SMK. Apalagi guru mata pelajaran IPA yang telah mengantongi sertifikasi lumayan banyak. Mungkin karena guru mata pelajaran IPA selain bisa mengajar di SMK juga bisa beralih mengajar IPA di SMP ataupun mengajar di SMA sesuai dengan bidangnya. Namun sebenarnya untuk berpindah jenjang pendidikan itu juga tergantung ada atau tidaknya lowongan (kekurangan guru) di sekolah tersebut, karena sebelum diberlakukannya K-13 pun kebutuhan guru untuk mata pelajaran tersebut telah tercukupi di sebagian besar sekolah.
