Penampilan perdana Bambang Pamungkas bersama Tim Nasional Indonesia adalah pada tahun 2 Juli 1999 dalam pertandingan persahabatan melawan Lituania. Bambang, yang saat itu masih berusia 18 tahun, dan berhasil mencetak sebuah gol dalam pertandingan yang berakhir seri 2-2. Pada tahun 2002, Bambang menjadi pencetak gol terbanyak dengan 8 gol dari 6 penampilan sekaligus membantu Indonesia menjadi juara kedua Piala Tiger 2002. Pada 10 Juli 2007, ketika pertandingan Indonesia vs Bahrain, ia mencetak gol, memastikan Indonesia menang 2-1. Bambang menjadi salah satu pemain pemegang rekor penampilan terbanyak dan menjadi Top Skor untuk Indonesia dengan 85 penampilan dengan perolehan 37 gol. Bambang Pamungkas menyatakan pensiun dari Timnas Indonesia Pada tanggal 1 April 2013.
Pada tanggal 15-16 Desember Bambang pamungkas mendapat kesempatan tampil dalam ajang FIFA Legends Cup yang di gelar di sela-sela Piala Dunia 2022 Qatar. dan sejumlah pemain Legendaris dari berbagai belahan dunia ikut tampil dalam ajang yang berlangsung di khalifa Internasional rennis dan Squash Complex tersebut. pertandingan dalam ajang tersebut digelar dengan waktu 2 x 15 menit dan terdapat delapan tim yang ikut berpartisipasi.
Bambang Pamungkas yang menjadi salah satu legenda yang ikut tampil dalam FIFA Legends Cup ia tergabung dalam tim East Tigers bersama sejumlah mantan pemain profesional yang pernah berkarir di Sepak Bola Eropa. Legenda sepak bola Indonesia itu berhasil mencetak gol nya dalam laga di fase grub, aksi Bambang Pamungkas banyak mencuri perhatian ketika dirinya membobol gawang African Lions.