Semua semangat, tekad, keberanian, keihklasan Gontor (yang di film dan di novel disebut Pondok Madani) di dasari pada dua senjata pamungkas di pondok ini. Panca Jiwa dan Motto pondok Modern. Bagi Gontor, dua hal tersebut ibarat UUD 1945 dan Pancasila bagi bangsa ini. Kedua hal tersebut adalah semboyan yang menjiwai dan menjadi semangat hidup Pondok Modern. Panca jiwa Pondok Modern berisi lima hal. keihkhlasan, kesederhanaan, berdikari, ukhuwah Islamiyah, dan jiwa bebas. Sementara motto pondok modern adalah berbudi tinggi, berbadan sehat, berpengetahuan luas dan berpikiran bebas.