Pada sela-sela agenda rapat yang dihadiri seluruh guru dan tenaga kependidikan, MAN 3 Bantul memanjatkan doa kesembuhan bagi warganya yang sedang mengalami musibah berupa sakit. Terdapat dua guru dan tenaga kependidikan yang didoakan yaitu Wiwik Arum Kusuma Ayu dan Eka Budi Riyanta. Keduanya secara berurutan merupakan guru biologi dan tenaga keamanan MAN 3 Bantul.