Pondok Pesantren Kyai Syarifuddin Wonorejo-Lumajang dikenal dengan lingkungannya yang bersih, karna pondok pesantren sangat menerapkan hadits tentang "annadhofatu minal iman" yakni menjaga kebersihan adalah sebagian dari iman. Dengan berpacunya kepada hadits tersebut, para santri akan gigih dalam menjaga kebersihan di lingkungan pesantren, seperti membuang sampah pada tempatnya, gotong royong bahkan sampai kebersihan masal.
"santri itu orang yang bersih, bersih hati juga bersih lingkungan, sedangkan bersih bagian dari iman. Jadi, Â jika ada santri yang tidak bersih maka bisa dikatakan santri yang tipis imannya". Ujar Pembina pondok pesantren Kyai Syarifuddin ketika menyampaikan sambutan dalam acara pembagian hadiah kepada santri madrasah diniyah. Minggu (25/12/2022).
Setiap hari jumat pagi, seluruh santri pondok pesantren Kyai Syarifuddin melaksanakan kegiatan rutinan  yakni kebersihan masal (jumat bersih). Kegiatan ini dilaksanakan setiap satu minggu sekali yakni pada hari jumat, mulai jam 06.00 sampai 08.30 WIB. Diadakannya program ini, supaya para santri bisa terbiasa jika sudah terjun langsung ke lingkungan masyarakat yaitu menerapkan rasa saling tolong menolong atau bergotong royong. Kemudian, dengan adanya kegiatan ini pondok pesantren akan tetap terjaga kebersihan dan keindahan lingkungannya.
Kegiatan kebersihan masal ini, dilakukan dengan cara besar-besaran atau bersama-sama. Contohnya seperti menyikat lantai kamar mandi, menyikat tempat sampah, menyikat lantai pondok serta menyiram halaman yang berdebu. Karena, untuk membersihkan satu pondok yang besar, tidak cukup hanya beberapa orang saja, tetapi membutuhkan santri dalam jumlah yang banyak.
Bukan hanya di hari jumat saja, setiap paginya para santri mengawali harinya dengan membersihkan lingkungan disekitar mereka. Seperti piket kamar, membuang sampah ke pembuangan sampah dan menata lemari baju, buku serta lemari-lemari umum ( lemari al-quran dan kitab-kitab).
