Embriologi perbandingan memberikan bukti kuat adanya evolusi karena menunjukkan kesamaan tahap awal perkembangan embrio antara spesies yang berbeda dengan menunjukkan dukungan (bukti) terhadap evolusi.Hal ini menunjukkan bahwa spesies tersebut mempunyai nenek moyang yang sama dan berevolusi dari nenek moyang yang sama.Misalnya, manusia dan monyet memiliki embrio yang sangat mirip pada tahap awal perkembangannya, namun kemudian mengalami perkembangan yang berbeda karena faktor genetik dan lingkungan yang berbeda.Hal ini menunjukkan bahwa manusia dan monyet memiliki nenek moyang yang sama dan berevolusi dari nenek moyang tersebut.
Embrio adalah tahap awal perkembangan organisme multiseluler, mulai dari pembuahan sel telur hingga kelahiran atau penetasan.Selama periode ini, janin mengalami serangkaian perubahan morfologi dan fungsional, tumbuh dan berkembang menjadi bayi utuh. Embriologi komparatif adalah cabang biologi yang mempelajari perkembangan komparatif embrio dari spesies berbeda. Dalam embriologi komparatif, para ahli membandingkan struktur dan perkembangan embrio organisme yang berbeda untuk memahami perbedaan dan persamaan dalam evolusi organisme tersebut.
Embriologi perbandingan sering kali membentuk homologi pada beberapa struktur, seperti kantung insang, yang menjadi sedemikian berubah pada perkembangan selanjutnya sehingga asal mulanya yang sama tidak lagi terlihat dengan jelas saat membandingkan dengan bentuknya yang telah berkembang secara lengkap. (Widodo, Lestari, U, Amin ,M:2003). embriologi perbandingan, yaitu cabang embriologi hewan yang mempelajari persamaan-persamaan dan perbedaan-perbedaan gambaran pola struktur embrio-embrio berbagai hewan dari spesies atau klasis yang berbeda yang umurnya sama. Suatu studi embriologi terhadap anggota anggota vertebrata menunjukkan adanya suatu kemiripan pada tahap tahap awal perkembangan embrio. Hal itu juga menunjukkan adanya kesamaan moyang.
Petunjuk bukti evolusi dapat juga ditemukan pada perkembangan beberapa organisme. Perkembangan sel telur yang sudah dibuahi hingga dilahirkan disebut embrio. Adapun ilmu tentang perkembangan organisme ini disebut Embriologi. Ketika membandingkan perkembangan organisme yang dekat kekerabatannya, terkadang sulit untuk membedakan tahap awal satu spesies dengan spesies lainnya. Awal perkembangan ikan mirip dengan perkembangan embrio hewan lain dan manusia. Meskipun bentuk dewasa setiap organisme tersebut jauh berbeda, kesamaan mereka saat awal perkembangannya merupakan hal yang menguatkan adanya kesamaan nenek moyang hewan-hewan tersebut. Kesamaan embrio ini sering digunakan sebagai petunjuk bukti adanya evolusi. Jika dua spesies berasal dari nenek moyang yang sama, keduanya mungkin masih memiliki kesamaan dalam perkembangannya.
