Babak 16 besar Liga 3 Nasional telah usai dan telah mengirimkan 8 wakil terbaik untuk berebut 6 slot guna promosi ke Liga 2 2024/2025.
Pada 16 besar terbagi menjadi 4 grup yang berisi masing-masing 4 tim. Grup A yang lolos babak 8 besar yakni Persikas Subang usai memperoleh 7 poin dari 3 laga yang sudah dilakoninya. Peringkat kedua yakni Persibo Bojonegoro dengan perolehan 6 poin. Sedangkan Waanal Brother Fc dan PSM Madiun gagal lolos 8 besar dan tetap tertahan di Liga 3.
Pada Grup B meloloskan Persiku Kudus yang memperoleh 6 poin dan Persekabpas Pasuruan yang memperoleh yang juga memperoleh 6 poin. Sedangkan PSGC Ciamis dan NZR Sumbersari tetap tertahan di Liga 3.
Grup C meloloskan Dejan Fc usai memperoleh 7 poin dan Tornado Fc yang memperoleh 4 poin. Sedangkan dua tim lainnya yakni PCB Persipasi Bekasi dan Persipani Paniai tetap bertahan di Liga 3.
Grup D meloloskan Persikota Tanggerang usai peroleh 7 poin dan Adhyaksa Farmel usai peroleh 5 poin. Dua tim yang tetap bertahan di Liga 3 yakni Persiba Bantul dan 757 Kepri Jaya FC.Â
Pada 8 tim yang lolos 8 besar Liga 3 Nusantara akan dibagikan kedalam 2 grup, masing-masing Grup diisi oleh 4 tim. Setiap 3 tim teratas klasemen akhir pada masing-masing grup berhak lolos ke Liga 2 2024/2025.
