Penggunaan pupuk organik dan pestisida alami juga dapat meningkatkan pertumbuhan tanaman dan mengurangi penggunaan pupuk kimia dan pestisida sintetis yang berbahaya bagi lingkungan dan kesehatan manusia.
Mengurangi limbah organik.
Eco enzyme dapat mengurangi limbah organik seperti sisa makanan dan sampah rumah tangga. Dengan menggunakan eco enzyme, limbah organik dapat diubah menjadi pupuk organik bahkan pestisida alami yang berguna bagi tanaman.
Sisa makanan dan sampah rumah tangga dapat menjadi limbah yang sulit diolah dan dapat mencemari lingkungan (menggunung di belakangan rumah, menumpuk tak karuan, dan menimbulkan bau busuk/tak sedap).
Mengurangi polusi dan intensitas terik matahari.
Dalam proses pembuatan eco enzyme, bahan-bahan organik yang digunakan diolah dengan cara alami tanpa campuran bahan kimia. Penggunaan eco enzyme mengurangi penggunaan bahan kimia dan mengurangi polusi lingkungan (akibat gas buang dari bahan organik yang tak dikelola).
Gas yang ditimbulkan dari akibat pembusukan di tempat pembuangan akhir sampah, terurai ke udara dan dipantulkan kembali ke bumi sehingga meningkatkan intensitas suhu permukaan bumi.
Apalagi risiko bahaya gas metana dalam tumpukan sampah, yang sewaktu-waktu dapat meledak bila ruang tak mampu mewadahi hal tersebut. Akhirnya jadi bencana alam yang memiliki tingkat bahaya tinggi akibat gas beracun bagi tubuh manusia.
Ekonomis.
Pembuatan eco enzyme dapat dilakukan dengan bahan-bahan yang mudah didapatkan dan tidak memerlukan biaya yang besar.