Manusia  hidup di alam semesta yang teratur di mana Tuhan telah menetapkan hukum alam untuk mengatur jalannya peristiwa yang normal. Gunung berapi yang meletus dapat dikaitkan dengan penyebab alami yang dapat dijelaskan secara ilmiah. Bersamaan dengan itu, letusan juga dapat dikaitkan dengan tujuan Tuhan, yang sesuai dengan judul umum "Penyelenggaraan Tuhan.".
Yang supranatural berada di atas hukum alam (seperti kebangkitan Nabi dll). Keajaiban selalu supranatural. Orang beragama menyebutnya Mukjizat adalah peristiwa di mana Tuhan campur tangan dan mengesampingkan "hukum" alam untuk melakukan sesuatu yang tidak pernah bisa terjadi "secara alami".Â
Namun, ini tidak berarti  keajaiban tidak dapat diverifikasi oleh penelitian ilmiah. Setelah kebangkitan Nabi Isa (suatu peristiwa supernatural), Dia meminta Tomas untuk memverifikasi hasilnya secara alami dengan memeriksa luka-luka yang masih terlihat ditangan dan lambungnya.
Menurut definisi, orang beragama  adalah supernaturalis, tetapi ini tidak berarti   tidak dapat menjadi ilmuwan yang secara kompeten mengintervensi dunia alam. Johannes Kepler, bersama dengan banyak ilmuwan perintis lainnya, adalah seorang supernaturalis.
Pada satu kesempatan, Kepler menulis: "Dia hanya memikirkan Tuhan menurut pikiran-Nya. Karena kita para astronom adalah imam dari Tuhan tertinggi sejauh menyangkut buku alam, kita harus berpikir, bukan tentang kemuliaan pikiran kita sebagai manusia unggul, tetapi pertama-tama, dalam kemuliaan kebesaran Tuhan".Â
Orang beragama mengklaim  Tuhan adalah Pencipta dan  penciptaan adalah tindakan supernatural, tetapi Tuhan merancang alam semesta untuk bekerja dengan cara yang teratur. Tatanan dan desain inilah yang memungkinkan studi sains.
Dengan maksud untuk mengubah fakta aneh menjadi fakta umum, semakin banyak filsuf abad ketujuh belas bersikeras  setiap peristiwa langka atau tidak biasa dapat direproduksi, dan kemudian menemukan penyebabnya, penjelasannya, menghilangkan jubah mistisisme . Dengan cara ini, yang dianggap supernatural menjadi sesuatu yang alami.
Galileo dengan demikian bersikeras  gunung-gunung di Bulan sama dengan gunung-gunung di Bumi. Atau  bulan-bulan Jupiter sama dengan bulan-bulan kita. Atau fase Venus sama dengan fase bulan kita. Seperti yang dijelaskan David Wootton dalam bukunya The Invention of Science : "Di setiap kesempatan, dia mengambil fakta-fakta yang paling aneh dan membuatnya sebiasa mungkin." Kesulitannya, kemudian, terletak pada mengetahui bagaimana dan kapan membedakan antara filsafat alam, dan teologi:
Logika Port-Royal menguraikan apa yang bisa salah ketika menggambarkan orang-orang yang terlalu mudah tertipu dalam hal keajaiban.Â
Mereka menelan, katanya, fakta yang aneh, dan ketika mereka menemukan keberatan untuk itu, mereka mengubah cerita mereka untuk mengakomodasi mereka; fakta aneh dapat bertahan hanya jika itu dibuat lebih alami, yang dalam hal ini menyiratkan, untuk memulai, bergerak semakin jauh dari kebenaran apa pun yang mungkin ada di dalamnya.
Simon Stevin, seorang ahli matematika, militer dan insinyur hidrolik Belanda, pembangun pabrik dan fortifikasi, ahli semiotika, akuntan, dan quartermaster berlimpah tentang hal ini, pada pertengahan 1600-an, dalam motonya "The wonder is not a wonder":
Pada kajian filsafat selalu kita harus melanjutkan dari kondisi heran ke non-heran, yaitu kewajiban untuk melanjutkan penelitian dilakukan dengan rigoritas sampai apa yang dianggap aneh tidak lagi tampak aneh bagi kita; kerena bisa dijelaskan dengan pengetahuan ilmah
Tetapi dalam teologi, kita harus melanjutkan dari ketidakheranan ke keajaiban, yaitu, kita harus mempelajari Kitab Suci Agama apapun sampai apa yang tampaknya tidak asing bagi kita tampak aneh bagi kita, dan  segala sesuatunya indah.
