Produksi film Habibie & Ainun yang ke-3 ini lebih berfokus pada cerita ibu Ainun dalam meraih mimpinya menjadi seorang dokter. Rudy bertemu dengan Ainun pada saat sekolah menengah atas, lama kelamaan Rudy mulai menyukai Ainun dan memberinya julukan "gula jawa"
Bermula dari harapannya untuk berkuliah di Universitas Indonesia Fakultas Kedokteran. Ia menyelesaikan kuliahnya hingga mendapatkan gelar lulusan terbaik oleh profesor. Mahasiswa laki-laki yang tidak terima mengamuk dan protes kepada pihak kampus atas keputusan tersebut.
Namun, Ainun membacakan pidato tentang emansipasi perempuan di dunia pendidikan.
Ahmad pria yang dekat dengan Ainun berasal dari keluarga terpandang dan ayahnya adalah dosen kedokteran, namun akhirnya Ainun memilih untuk mengakhiri hubungan tersebut karena Ahmad yang mudah terpancing emosi dan ingin pindah negara untuk tidak tinggal di Indonesia, berbeda dengan prinsip Ainun yang ingin tetap singgah di Indonesia.
Pada akhir film muncul Habibie sebagai pasangan hidupnya.
