Drama Poong the Joseon psychiatrist season 2 dimulai dengan sosok Yoo Se Yeob yang sedang mengobati seorang pasien. Kali ini dia dikenal sebagai sosok ahli kejiwaan. Klinik Gyesoo yang dulu berada di Desa Sorak, kini sudah membuka cabang di Hanyang. Tabib Gye, Yoo Se Yeob, Man Bok, nenek, Namhae, Ip Bun, dan Jang Gun kini bekerja di Klinik Gyesoo di Hanyang.
Pada malam hari, Tabib Gye dan Tabib Yoo pergi ke kerajaan untuk memeriksa Raja. Kali ini, tersebar rumor tentang kutukan Penasihat Negara Kedua, Cho Tae Hak yang menjadi hantu gentayangan di istana. Seorang dayang istana mendapat sebuah surat yang memintanya pergi ke sumur di sekitar kediaman permaisuri. Di sana, dia melihat hantu Cho Tae Hak. Usai melihat hantu, dia jatuh sakit. Hal ini juga terjadi pada dayang istana lain yang jumlahnya setiap hari kian banyak.
Sementara itu di tempat lain saat sedang makan bersama, Tabib Gye dan yang lain memberi tahu bahwa Eun Woo akan datang ke Hanyang. Namun, dia tidak memberi tahu Tabib Yoo.
Di istana, petugas medis dari kantor medis istana sedang mengobati pasien yang semakin bertambah. Di aula istana, Raja memutuskan akan memanggil Tabib Gye dan Tabib Yoo ke istana untuk membantu. Namun hal itu ditentang oleh para menteri dengan menganggap bahwa hal tersebut melanggar undang-undang. Raja tak peduli dan tetap memanggil Tabib Gye dan Tabib Yoo untuk membantu menyelesaikan masalah di istana.
Tabib Gye dan Tabib Yoo pun dipanggil ke istana. Mereka mulai melakukan pemeriksaan. Menurut diagnosa awal dari kantor medis bahwa para dayang keracunan. Sementara menurut diagnosa Tabib Gye dan Tabib Yoo, para dayang tidaklah keracunan karena tidak ditemukan racun di makanan mereka. Kantor medis kerajaan merasa bahwa diagnosa mereka tidak salah. Mereka bahkan menentang kedatangan Tabib Yoo di istana.
Di tempat lain, di pelabuhan, Eun Woo melihat ada seseorang yang tiba-tiba pingsan. Dia segera menyelamatkan pasien tersebut. Sementara itu, di istana, saat Jeon Kang Il sedang mengobati pasien, tiba-tiba datang seorang dayang. Tabib Yoo menduga bahwa itu adalah glukoma. Akan tetapi Jeon Kang Il tidak percaya dan mengatakan bahwa diagnosa kantor medis tidak ada yang salah.
Suatu hari Tabib Gye dan Tabib Yoo membawa anggota klinik Gyesoo datang ke istana dengan membawa bahan obat dari klinik mereka. Hal itu dilakukan setelah mereka ditolak saat meminta bahan obat di kantor medis kerajaan. Dalam perjalanan mereka bertemu dengan Tuan Putri. Saat melihat Yoo Se Yeob, Tuan Putri jatuh cinta, begitupun Tabib Gye ketika melihat dayang istana senior. Ada benih-benih cinta diantara mereka.
Tabib Yoo sangat senang ketika Eun Woo tiba. Dia bahkan sempat memikirkan bahwa dia sedang berhalusinasi. Padahal sebenarnya Eun Woo yang datang kala itu adalah Eun Woo yang nyata. Tabib Yoo pun bercerita tentang masalah dayang istana pada Eun Woo. Mereka berdua segera menyelidikinya. Mereka pergi ke sumur tempat dayang istana pertama kali melihat hantu Cho Tae Hak.
Di sana mereka mencium aroma bunga lili. Tak lama kemudian terdengar suara teriakan Tuan Putri yang melihat hantu. Tak disangka, Tuan Putri langsung memeluk Tabib Yoo saat dia datang membantu. Eun Woo segera berlari ke arah Tuan Putri yang melihat hantu. Di sana dia menabrak Jeon Kang Il. Saat sedang berpelukan, Tabib Yoo melihatnya. Dia langsung menarik Eun Woo dan mengatakan bahwa Jeon Kang Il tidak sopan. Inilah awal pertempuran keduanya. Bagaimana persaingan keduanya? Apakah hubungan Tabib Yoo dan Eun Woo akan berjalan lancar? Apa yang sebenarnya terjadi pada para dayang? Bisakah mereka menyelesaikan kasus ini? Simak di spoiler episode berikutnya.