Filosofi, Visi, Misi, Tujuan dan Nilai-Nilai
JDU menjujung tinggi filosofi akses ke pendidikan tinggi adalah hak azasi warga negara dan  institusi pendidikan adalah wahana pertumbuhan indidividu dan perubahan sosial. Sedangkan Visi JDU adalah Menjadikan UDJ sebagai wahana persatuan dan kesatuan dalam wadah NKRI untuk pembangunan ekonomi nasional, perdamaian dan  pembangunan ekonomi dunia. Selanjutnya, JDU bertekad melaksanakan Misi Menyediakan pendidikan online jenjang Diploma, Sarjana dan Pasca  Sarjana yang berkualitas dengan biaya terjangkau untuk setiap mahasiswa yang memenuhi persyaratan.
Tim Kerja Konsorsium Pendirian JDU sepakat menetapkan tujuan JDU yang mencakup, tetapi tidak terbatas pada, pelayanan pendidikan tinggi untuk mahasiswa dengan latar belakang yang beragam dan menjamin kualitas program studi. Last but not least, ada empat Nilai-nilai luhur JDU yaitu  keterjangkauan pendidikan, supremasi kebhinekaan, integritas, dan kualitas.
Program Studi Universitas Digital Jakarta
Berdasar hasil kajian sendiri, dengan mempertimbangakan jenis kahlian/kompetensi yang dibutuhkan dalam pembangunan dan ekonomi serta pertimbangan minat calon mahasiswa, dalam perspektif empat tahun pertama JDU sedang menggodok lima Program Studi, sebagai berikut.Â
1. Program Studi Ekonomi dan Bisnis dengan konsentrasi  administrasi bisnis: D2, S1, dan S2
2. Program Studi Ilmu Hukum dengan konsentrasi hukum teknologi informasi dan privasi: S2
3. Program Studi Teknologi Energi dengan konsentrasi energi baru dan terbarukan: S1
4. Program Studi Ilmu Komputer dengan konsentrasi rekacipta komputer dan perangkat lunak serta teknologi informasi: D1, D2, dan S1
5. Program Studi Agroteknologi Pangan dengan konsentrasi pertanian presisi (precision/smart farming) dan ketahanan pangan: S2
Dua program studi pertama tersebut berada di bawah Fakultas llmu Sosial dan Humaniora sedangkan tiga program studi tersebut terakhir di bawah Fakultas Sains dan Teknologi.Â